故事开始于1866年，当时海上出现了一种被称为“海怪”的不明生物，频繁袭击过往船只。为了揭开这个谜团，美国政府派遣战舰“林肯号”进行追捕。然而，在追逐过程中，“林肯号”不幸遭遇事故，阿龙纳斯教授和他的仆人康塞尔被抛入海中，并意外登上了一艘神秘的潜水艇——“鹦鹉螺号”。
尼摩船长是一位性格复杂且极具智慧的人物，他驾驶着这艘先进的潜艇穿梭于各大洋之间。从太平洋出发，“鹦鹉螺号”依次经过了托雷斯海峡、印度洋、红海、地中海等海域，最终抵达大西洋。每一段航程都充满了新奇与挑战，让读者仿佛置身于一个全新的世界。
在这些旅程中，阿龙纳斯教授不仅见识到了许多罕见的海洋生物，还目睹了海底火山爆发、沉没的亚特兰蒂斯遗迹以及丰富的矿产资源。同时，他也逐渐了解到尼摩船长内心深处的孤独与痛苦，这位隐居深海的天才科学家其实背负着沉重的历史创伤。
整部作品以严谨的科学知识为基础，结合浪漫主义色彩，构建了一个既真实又梦幻的故事框架。通过细腻的描写和紧凑的情节安排，《海底两万里》成功地将自然科学与文学艺术完美融合，成为一部跨越时代的经典之作。它不仅仅是一次关于探索与发现的冒险，更是一部启发人们思考人类命运与自然关系的伟大篇章。
